News list

May 23, 2018

Доклад по результатам проекта РНФ

Timur Madzhidov

Доклад по результатам проекта РНФ

Сделал 20-минутный обзорный доклад по некоторым результатам нашего научного проекта "Моделирование органических и метаболических реакций методами хемоинформатики: от эмпирической к предсказательной химии" в Университете Бар-Илан, Тель Авив, Израиль, в рамках Первой франко-израильской конференции по хемоинформатике.

О чем говорил: -в чем сложность моделирования реакций? -как искать схожие реакции? -как предсказывать характеристики реакций (скорости, констан...

Read More

May 23, 2018

Список groundbreaking статей по версии Nature

Timur Madzhidov

Список groundbreaking статей по версии Nature

Nature опубликовала groundbreaking список статей 2017 года (причем не только из этого журнала), выбранных главным редактором секции "химия". Иногда выбор сражает своей непосредственностью: например, доставила удовольствие статья о гендерном неравенстве в изучении STEM cells. Но в остальном достаточно интересно.

Но лично меня очень порадовало попадание в лист статьи (№22 в списке) нашего друга Ханока Шендеровича из Университета Бар Илан по резуль...

Read More

May 22, 2018

Прием в Магистратуру 2018

Ramil Nugmanov

Магистратура Химического института им. А.М. Бутлерова КФУ

04.04.01 Химия

Хемоинформатика и молекулярное моделирование

Название профиля подготовки: «Хемоинформатика и молекулярное моделирование»

Присваивается степень или квалификация: магистр

Язык обучения: русский

Период обучения: 2 года

Стоимость обучения в 2017-2018 уч. году: 94 800 руб. (1 курс), 189 600 руб. (полная стоимость обучения)

Куратор программы: проф. ...

Read More

May 17, 2018

Сертификаты прошедшим курс от Пфайзера

Timur Madzhidov

Сертификаты прошедшим курс от Пфайзера

Наконец-то мы решили все сложности и вручили сертификаты студентам, которые прошли курс по Вычислительной и медицинской химии в рамках программы "Больше чем образование" от компании Пфайзер. По результатам курса мы провели тестирование и сертификат получают только те, кто успешно прошел его.

Спасибо всем, кто принял участие! Поздравляю всех, кто успешно окончил курс. Фоточки некоторых счастливчиков прикреплены. Иногородние студенты ([id3534153|Karina...

Read More

May 16, 2018

Центр Алгоритмической Биотехнологии СПбГУ объявляет набор студентов, аспирантов и выпускников на...

Timur Madzhidov

Центр Алгоритмической Биотехнологии СПбГУ объявляет набор студентов, аспирантов и выпускников на летние стажировки 2018 года. Основателем и руководителем Центра является Павел Певзнер, профессор Калифорнийского Университета в Сан-Диего. Центр Алгоритмической Биотехнологии занимается решением задач, связанных с разработкой алгоритмов для анализа биологических данных.

Стажировка в лаборатории — это возможность применить свои навыки в области программирования и математики для решения актуальны...

Read More

May 16, 2018

Полезные советы начинающим Python'щикам

Timur Madzhidov

Полезные советы начинающим Python'щикам

Интересный материал для тех, кто начал программировать на Python, но еще не постиг всех его тонкостей. Несколько советов от профессионалов с примерами кода как решать те или иные задачи с использованием необычных подходов, или редко используемых типов данных. Есть примеры и понятное объяснение.

https://proglib.io/p/python-tips/

Links:

Read More

May 14, 2018

Дорогие друзья!

Timur Madzhidov

Дорогие друзья!

Магистратура по Хемоинформатике и молекулярному моделированию Казанского Федерального Университета вновь объявляет набор абитуриентов! Если ты любишь химию и компьютеры, хочешь научиться программировать, любишь сложные задачи на стыке наук, не боишься сложностей и нового - то наша магистратура для тебя!

Хемоинформатика – наука на стыке химии, информатики, биологии, фармакологии, физики и математической статистики, занимающееся извлечением информации из массива эксперимента...

Read More

May 14, 2018

#ИТИС_анонс

Timur Madzhidov

ИТИС_анонс

Приглашаем принять участие в 12-ой летней школе RuSSIR 2018 в Казани! Заявки принимаются до 10 июля 2018 года. Программа школы: http://romip.ru/russir2018/russir-2018-program/ Контакты: russir2018@gmail.com

RuSSIR #RuSSIR2018 #Казань #КФУ #ИТИС #Kazan #KFU

Links:

Read More

May 02, 2018

Всех поздравляю с 1 Мая! Здоровья, счастья, весны в душе и радости в труде!

Timur Madzhidov

Всех поздравляю с 1 Мая! Здоровья, счастья, весны в душе и радости в труде!

И по случаю праздника у меня два "детских" вопроса: 1) Вращаемая ли двойная связь? 2) Сохраняется ли порядок связи при записи молекулы в файл PDB? Или все связи окажутся одинарными?

Заранее спасибо.

Read More

April 30, 2018

Подготовка молекул к виртуальному скринингу

Timur Madzhidov

Подготовка молекул к виртуальному скринингу

Кто пробовал делать докинг или иной виртуальный скрининг, где важна 3D структура, наверное, заметил, сколько на это уходит труда: подготовить молекулы, стандартизовать, удалить дубликаты, а потом стереохимия, таутомеры и конформации становятся кошмаром.

В статье Паскаля Боне в Molecular Informatics приводится описание протокола, подготовленного для KNIME, который делает всю эту работу. Ну и заодно описываются некоторые проблемы, статистика и много...

Read More