News list

January 25, 2018

ГЕНЕРАЦИЯ СФОКУСИРОВАННЫХ КОМБИНАТОРНЫХ БИБЛИОТЕК С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЛУБОКИХ НЕЙРОННЫХ СЕТЕЙ

Timur Madzhidov

ГЕНЕРАЦИЯ СФОКУСИРОВАННЫХ КОМБИНАТОРНЫХ БИБЛИОТЕК С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГЛУБОКИХ НЕЙРОННЫХ СЕТЕЙ

После каникул перестал выкладывать интересные статьи из-за некоторой занятости. Продолжаем...

Интересная статья - ребята предложили как можно генерировать структуры соединений напрямую с помощью нейронных сетей причем так, чтобы полученные соединения обладали требуемыми свойствами. Причем это делается без виртуального скрининга. И как обычно в последнее время на помощь пришло глубокое обучение.

http...

Read More

January 22, 2018

Летняя школа в исследовательском центре CERN

Timur Madzhidov

Летняя школа в исследовательском центре CERN

Бакалавры и магистранты, у которых не будет этим летом защиты диплома! Успейте податься на летнюю школу в исследовательский центр CERN! Я думаю будет очень интересно. Все подробности и описание по ссылке. https://scijob.ru/grant/2308

Links:

Read More

January 22, 2018

Позиция пост-дока в NCATS Informatics group, США

Timur Madzhidov

Позиция пост-дока в NCATS Informatics group, США

NCATS Informatics group is seeking a creative, self-motivated post-doctoral scientist to work on development of new algorithms for prediction of i) protein–ligand interactions; ii) chemical reactions, and comprehensive support of drug discovery projects. NCATS (National Center for Advancing Translational Sciences) is one of the centers at the National Institutes of Health (NIH). The Informatics group collaborates closely with biologists and c...

Read More

January 19, 2018

Друзья,

Timur Madzhidov

Друзья, Мы с Пашей Полищуком из Института трансляционной медицины Университета Оломоуца, Чехия, выиграли совместный грант и теперь он ищет аспиранта под исследования по этой тематике. У меня есть аспиранты и сотрудники, а ему нужны активные и заинтересованные люди.

Проект связан с разработкой нового инструмента для проведения фармакофорного поиска и фармакофорного отображения.

Так что мы ищем трудоспособного и активного человека, который имеет высшее образование или заканчивает в этом году...

Read More

January 14, 2018

PlayMolecule: it is a repository of best-in-kind applications regarding

Timur Madzhidov

PlayMolecule: it is a repository of best-in-kind applications regarding molecular predictors and tools for modeling and molecular dynamics simulations.

Those applications are: Kdeep, an affinity constant predictor; DeepSite, a binding site detector; ProteinPrepare, an accurate protocol to prepare proteins for MD simulations; LigVoxel, a ligand properties estimator based on binding pocket structure; CryptoScout, a cryptic pocket detector based on benzene MD simulations. More will come soon. Y...

Read More

January 12, 2018

Федя, где мой квантовый телефон? Сейчас будем Фулерен считать!

Timur Madzhidov

Федя, где мой квантовый телефон? Сейчас будем Фулерен считать!

Квантовая химия - передовой край теоретической химии. Какие только перспективы не сулит эта область. Но проблема всегда одна - нет достаточной мощности провести нормальные расчеты. Всегда требуется принимать всё новые и новые упрощения. При этом также падает и сложность систем, которые хотелось бы помоделировать. Но что, если упрощения больше не нужны? Запусти Докинг лиганда с белком на квантах и получи ответ через 5 минут. Реаль...

Read More

January 10, 2018

#bioinfcontest #bioinfcontest2018

Timur Madzhidov

bioinfcontest #bioinfcontest2018

[club29354345|Институт биоинформатики] совместно с [club94|Университетом ИТМО] проведут вторую онлайн-олимпиаду по биоинформатике Bioinformatics Contest 2018!

Для победы нужно решить как можно больше биоинформатических задач за 24 часа, используя любой удобный язык программирования. Если вы хотите попробовать свои силы, спешите подписаться на новости bioinf.me/contest!

Олимпиада пройдет полностью онлайн на платформе [club74099769|Stepik]. Отборочный ...

Read More

January 09, 2018

ТРЕТЬЯ ШКОЛА-СЕМИНАР "ОТ ЭМПИРИЧЕСКОЙ К ПРЕДСКАЗАТЕЛЬНОЙ ХИМИИ"

Timur Madzhidov

ТРЕТЬЯ ШКОЛА-СЕМИНАР "ОТ ЭМПИРИЧЕСКОЙ К ПРЕДСКАЗАТЕЛЬНОЙ ХИМИИ"

Друзья, с 5 по 6 апреля 2018 года мы проведем пока что последний из запланированных школ-семинаров "От эмпирической к предсказательной химии". Это мероприятие поддерживается Российским научным фондом в рамках нашего проекта 14-43-00024, который в 2018 году, к сожалению, заканчивается.

НО ПОКА! Мы ждем всех, кто использует вычислительные подходы в решении задач химии, дизайне веществ и материалов. Программа мероприятия уто...

Read More

January 09, 2018

АРТЕФАКТЫ ХИМИЧЕСКИХ СВЯЗЕЙ

Timur Madzhidov

АРТЕФАКТЫ ХИМИЧЕСКИХ СВЯЗЕЙ

Химическая связь - штука довольно неопределенная. Как человек, который в кандидатской диссертации занимался изучением природы связи, могу сказать, что нормального, устраивающего всех определения что такое химическая связь - нет. Эта проблема очень сильно стоит в квантовой химии, поскольку как таковое, понятие связи исчезает, когда проводится расчет с помощью метода молекулярных орбиталей - действительно, в волновой функции и электронной плотности нет никакого наме...

Read More

December 01, 2017

Pavel Polishchuk

Ramil Nugmanov

Senior resercher in Instutute of Molecular and Translational Medicine, Palacky University in Olomouc (Czech Republic).

Read More