News list

November 26, 2018

#sj_Гранты

Timur Madzhidov

sj_Гранты

Стипендия им. В.И. Вернадского посольства Франции 1 060 евро в месяц

Заявки принимаются до 21 декабря 2018 года.

Посольство Франции в России присудит в 2019 году гранты аспирантам, проходящим обучение в совместной франко-российской аспирантуре.

​Кандидатская диссертация при совместном франко-российском научном руководстве может быть написана по любой преподаваемой во Франции научной дисциплине.

Стипендия в размере 1 060 евро в месяц предоставляется на период максимум 6...

Read More

November 26, 2018

FINDSITEcomb2.0: A New Approach for Virtual Ligand Screening of Proteins and Virtual Target...

Timur Madzhidov

FINDSITEcomb2.0: A New Approach for Virtual Ligand Screening of Proteins and Virtual Target Screening of Biomolecules

статьядня #безкомментариев #статья

Не всегда хватает времени писать подробно. Сделаем рубрику "Статья дня". Делюсь статьями которые мне кажутся интересными.

Очередная статья, в которой предлагается подход для определения мишени для молекулы. Реализован свободно доступный интерфейс, который можете попробовать.

Абстракт:

Computational approaches for predicting protein–lig...

Read More

November 20, 2018

Программирование на Java

Timur Madzhidov

Программирование на Java

Лекция 1. Введение в Java Лекция 2. Базовый синтаксис Java Лекция 3. Объекты, классы, интерфейсы, строки Лекция 4. Пакеты, исключения, дженерики Лекция 5. Varargs, try-finally, коллекции Лекция 6. Коллекции, компараторы, лямбды, hashCode Лекция 7. Элементы функционального программирования на Java Лекция 8. Stream API Лекция 9. Ввод-вывод Лекция 10. Многопоточность

java@bookflow

Links:

Read More

November 19, 2018

ЛЕКЦИИ ПО ХЕМОИНФОРМАТИКЕ

Timur Madzhidov

ЛЕКЦИИ ПО ХЕМОИНФОРМАТИКЕ

Довольно полная компиляция лекций по разным аспектам хемоинформатики от гуру в этой области. Но сильно радоваться не стоит - платно... Но как я понял можно получить бесплатный триал. Какие дает права - не знаю, не пробовал. Кто попробует - напишите в комментариях, можно ли весь курс посмотреть по триалу?

https://hstalks.com/playlist/582/introduction-to-cheminformatics/?biosci

Links:

Read More

November 15, 2018

РЕСУРСЫ

Timur Madzhidov

РЕСУРСЫ В обсуждениях мы создали список ресурсов, которые могут быть полезны для тех, кто работает в молекулярном моделировании:

Блоги по вопросам, связанным с хемоинформатикой: https://vk.com/topic-107190233_39782773

Программы для вычислительной химии: https://vk.com/topic-107190233_39785310

Read More

November 15, 2018

AWESOME CHEMOINFORMATICS: компиляция программ по вычислительной химии

Timur Madzhidov

AWESOME CHEMOINFORMATICS: компиляция программ по вычислительной химии

Представляю Вашему вниманию две oчень полезные компиляции бесплатных инструментов в области вычислительной химии - все с рабочими ссылками. Листы обновляются и курируются. Рассматривается все - от молдинамики до хемоинформатики

AWESOME CHEMOINFORMATICS: https://github.com/hsiaoyi0504/awesome-cheminformatics

Open Source Molecular Modeling: https://opensourcemolecularmodeling.github.io/

Links:

Read More

November 14, 2018

БЛОГИ ПО ХЕМОИНФОРМАТИКЕ

Timur Madzhidov

БЛОГИ ПО ХЕМОИНФОРМАТИКЕ

Хотел поделиться интересными ресурсами, которые посвящены хемоинформатике. В них есть что почитать!

Предложение: 1. Если найдете что-то интересное - предлагаю делиться со всеми - писать посты, я буду принимать, если оно относится к теме группы.

  1. Если вам известные еще какие-нибудь блоги - пишите в комменты, добавлю в этот пост.

БЛОГИ:

Practical chemoinformatics (Пэт Уолтерс) - всякое http://practicalcheminformatics.blogspot.com/

Хемоинформатика 2.0 https://che...

Read More

November 13, 2018

КОМПАНИЯ BIOSOLVEIT ОБЪЯВЛЯЕТ КОНКУРС ПРЕДЛОЖЕНИЙ НА WINTER2018 CHELLENGE

Timur Madzhidov

КОМПАНИЯ BIOSOLVEIT ОБЪЯВЛЯЕТ КОНКУРС ПРЕДЛОЖЕНИЙ НА WINTER2018 CHELLENGE

Нужно предложить тему исследований на 3 месяца, с указанием какие цели и как будут решаться. Лучшая идея исследований получит 1000 евро и 5 лучших предложений получат бесплатный софт от BioSolveIT (у них очень хорошая программа докинга FlexX и куча других полезных инструментов для structure-based drug design.

От компании:

Want to win a travel grant worth €1,000? If you are an academic or independent researcher, you ...

Read More

November 12, 2018

Tautomeric Equilibria Database.

Timur Gimadiev

Database consist of 3 .RDF files (1 train set and 2 test sets). To obtain .RDF files, please click to download.

Read More

November 11, 2018

Переносчики мыслей

Timur Madzhidov

Переносчики мыслей

Что сказал бы инженер, если бы перед ним поставили ванну с водным раствором органических веществ и попросили сделать из этого проводящий контур? В лучшем случае инженер воздержится от слов, а просто плюнет в раствор и уйдёт искать что-нибудь металлическое. Наши далёкие предки, первые многоклеточные Земли, не умели оценивать вероятность успеха, и времени у них было много. В бульоне жизни отыскались гидрофильные и липофильные молекулы — с их помощью удалось разделить водну...

Read More