News list

September 04, 2018

Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive chemistry"

Ramil Nugmanov

The Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive chemistry" (E2PC2018) was held in Kazan on 5-7 April, 2018.

The Book of abstracts

The Book of abstracts accepted for presentation in the Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive chemistry" is available under the link.

About the School-seminar

The School-seminar is regular event organized in the framework of the p...

Read More

August 20, 2018

Поделюсь новостью из мира хемоинформатики.

Timur Madzhidov

Поделюсь новостью из мира хемоинформатики.

Какое-то время назад я здесь же писал про PPB Polypharmacology Browser (http://gdbtools.unibe.ch:8080/PPB/), созданный группой исследователей под руководством проф. Jean-Louis Reymond и предсказывающий мишень по комбинации дескрипторов.

Совсем недавняя новость, публикация этого месяца, и то пока препринт: авторы выпустили улучшенную версию своего сервиса – PPB2. Сама она находится здесь: http://ppb2.gdb.tools/ А публикация для цитирования – здес...

Read More

August 18, 2018

Поделюсь новостью из мира хемоинформатики.

Timur Madzhidov

Поделюсь новостью из мира хемоинформатики.

Какое-то время назад я здесь же писал про PPB Polypharmacology Browser (http://gdbtools.unibe.ch:8080/PPB/), созданный группой исследователей под руководством проф. Jean-Louis Reymond и предсказывающий мишень по комбинации дескрипторов.

Совсем недавняя новость, публикация этого месяца, и то пока препринт: авторы выпустили улучшенную версию своего сервиса – PPB2. Сама она находится здесь: http://ppb2.gdb.tools/ А публикация для цитирования – здес...

Read More

August 16, 2018

КУРС ОТ КОМПАНИИ PFIZER "More than Education: Medicinal and Computational Chemistry Course 2018"

Timur Madzhidov

КУРС ОТ КОМПАНИИ PFIZER "More than Education: Medicinal and Computational Chemistry Course 2018"

Друзья! Нам удалось опять договориться с компанией Pfizer (США) прочитать курс лекций по вычислительной и медицинской химии в КФУ с 10 по 12 сентября (предварительно). От компании Файзер выступят: - Юрий Абрамов - специалист по хемоинформатике и вычислительному дизайну лекарств, в настоящее время занимается вопросами применения вычислительных подходов на этапе развития (development) и внедрения л...

Read More

July 28, 2018

Расскажу ещё про один полезный и интересный сервис.

Timur Madzhidov

Расскажу ещё про один полезный и интересный сервис.

Как известно, структуры PDB – самые точные в плане 3D-структуры белка – имеют один значимый недостаток. Некоторые фрагменты не могут быть однозначно интерпретированы при обработке, в результате чего остаются прорехи (gaps) в структуре белка. Для докинга без учёта гибкости полипептидного остова белка, как в программах семейcтва AutoDock, это не проблема. Но это абсолютно неприемлемо для молекулярной динамики или производных от неё методик, ...

Read More

July 27, 2018

Расскажу ещё про один полезный и интересный сервис.

Timur Madzhidov

Расскажу ещё про один полезный и интересный сервис.

Как известно, структуры PDB – самые точные в плане 3D-структуры белка – имеют один значимый недостаток. Некоторые фрагменты не могут быть однозначно интерпретированы при обработке, в результате чего остаются прорехи (gaps) в структуре белка. Для докинга без учёта гибкости полипептидного остова белка, как в программах семейcтва AutoDock, это не проблема. Но это абсолютно неприемлемо для молекулярной динамики или производных от неё методик, ...

Read More

July 24, 2018

Постдоки по хемоинформатике

Timur Madzhidov

Постдоки по хемоинформатике

Университет Северной Каролины в Чапелл-Хилл. Группа Дени Фурша: New postdoc position available in my group at @NCStateChem starting September 1rst 2018. If interested in #cheminformatics please send me your CV at dfourch@ncsu.edu Thanks!

Read More

June 17, 2018

Интересный курс по нейронным сетям для новичков

Timur Madzhidov

Интересный курс по нейронным сетям для новичков

Наверное обратили внимание, что самая модная тема сейчас в приложениях IT к различным наукам, это искусственный интеллект. На самом деле имеются в виду очень хитрые архитектуры нейронных сетей, которые позволяют решать самые различные задачи. И я периодически делать посты о них.

Ну так вот. На хабре - интересный курс о ннйронках для чайников. Довольно большой, но я посмотрел - мне понравилось. На самом деле понятно и весьма полноценно. Только ...

Read More

June 15, 2018

Хорошие новости

Timur Madzhidov

Хорошие новости

У нас есть маленький предмет для гордости и не могу им не поделиться. Точнее повода целых три: - [id62697988|Айгуль Хакимова], студентка, работающая у нас в лаборатории со своего первого или второго курса, выиграла грант компании [club53768810|BIOCAD] на прохождение у них практики! И скоро она едет к ним в Санкт-Петербург на 2-месячную стажировку. Я уверен, будет очень интересно! Я был у них - это очень крутая и очень динамично работающая компания. А еще они делают крутую выч...

Read More

June 15, 2018

Chiral cliff - новая и простая концепция

Timur Madzhidov

Chiral cliff - новая и простая концепция

То что стереохимия молекулы сильно влияет на свойства - дело известное. И что влияют на биологическую активность - никого не удивишь. И история с талидомидом набила оскомину у студентов и не только.

А почему у некоторых молекул стереоизомеры обладают одинаковой активностью, а для некоторых - напротив, она очень отличается? Очевидно, причина в том, что в последнем случае стереоизомеры распознаются ферментом по разному. Точнее, один из стереоизомеров ...

Read More