News list

May 16, 2018

Полезные советы начинающим Python'щикам

Timur Madzhidov

Полезные советы начинающим Python'щикам

Интересный материал для тех, кто начал программировать на Python, но еще не постиг всех его тонкостей. Несколько советов от профессионалов с примерами кода как решать те или иные задачи с использованием необычных подходов, или редко используемых типов данных. Есть примеры и понятное объяснение.

https://proglib.io/p/python-tips/

Links:

Read More

May 14, 2018

Дорогие друзья!

Timur Madzhidov

Дорогие друзья!

Магистратура по Хемоинформатике и молекулярному моделированию Казанского Федерального Университета вновь объявляет набор абитуриентов! Если ты любишь химию и компьютеры, хочешь научиться программировать, любишь сложные задачи на стыке наук, не боишься сложностей и нового - то наша магистратура для тебя!

Хемоинформатика – наука на стыке химии, информатики, биологии, фармакологии, физики и математической статистики, занимающееся извлечением информации из массива эксперимента...

Read More

May 14, 2018

#ИТИС_анонс

Timur Madzhidov

ИТИС_анонс

Приглашаем принять участие в 12-ой летней школе RuSSIR 2018 в Казани! Заявки принимаются до 10 июля 2018 года. Программа школы: http://romip.ru/russir2018/russir-2018-program/ Контакты: russir2018@gmail.com

RuSSIR #RuSSIR2018 #Казань #КФУ #ИТИС #Kazan #KFU

Links:

Read More

May 02, 2018

Всех поздравляю с 1 Мая! Здоровья, счастья, весны в душе и радости в труде!

Timur Madzhidov

Всех поздравляю с 1 Мая! Здоровья, счастья, весны в душе и радости в труде!

И по случаю праздника у меня два "детских" вопроса: 1) Вращаемая ли двойная связь? 2) Сохраняется ли порядок связи при записи молекулы в файл PDB? Или все связи окажутся одинарными?

Заранее спасибо.

Read More

April 30, 2018

Подготовка молекул к виртуальному скринингу

Timur Madzhidov

Подготовка молекул к виртуальному скринингу

Кто пробовал делать докинг или иной виртуальный скрининг, где важна 3D структура, наверное, заметил, сколько на это уходит труда: подготовить молекулы, стандартизовать, удалить дубликаты, а потом стереохимия, таутомеры и конформации становятся кошмаром.

В статье Паскаля Боне в Molecular Informatics приводится описание протокола, подготовленного для KNIME, который делает всю эту работу. Ну и заодно описываются некоторые проблемы, статистика и много...

Read More

April 28, 2018

Глубокое обучение для дизайна молекул с заданными фотоэлектронными свойствами

Timur Madzhidov

Глубокое обучение для дизайна молекул с заданными фотоэлектронными свойствами

Sumita and co-workers combine Monte Carlo tree search (MCTS) and a recurrent neural network (RNN) to discover molecules with specific excitation levels.

At the core of the method (called ChemTS) is a RNN trained to generate SMILES string representations of molecules. Trained on thousands of valid SMILES strings, the RNN predicts that, for example, a likely next character in the SMILES string "c1ccccc" is "1" (to...

Read More

April 26, 2018

Визит компании InSilico

Timur Madzhidov

Визит компании InSilico

В эти дни (с понедельника по четверг) несколько раз встречались с представителями компании InSilico Medicine, которая входит в топ-100 самых перспективных компаний в области AI. Они участвовали в конференции по Anti-aging Rеsearch, и заодно заглянули к нам на огонек. Обсуждали научные проекты и перспективы сотрудничества. [id14706280|Марк Веселов] прочел интереснейший доклад о последних достижениях в глубоком обучении в химии (отметив не только себя, но и конкурентов,...

Read More

April 26, 2018


April 25, 2018

Postdoctoral Researcher in Computational ADME/Toxicology - ATOM Consortium

Timur Madzhidov

Postdoctoral Researcher in Computational ADME/Toxicology - ATOM Consortium

работа

Employer GlaxoSmithKline Location Sacramento, CA, USA Sacramento California Salary Competitive Posted Apr 19, 2018 Closes Apr 25, 2018

Your Responsibilities: GSK recently declared its intention to create the Accelerating Therapeutics for Opportunities in Medicine (ATOM) Consortium with the National Cancer Institute (NCI) and the U.S Department of Energy (DOE). This consortium aims to dramatically accel...

Read More

April 24, 2018

CC2AI: Computational Chemistry meets Artificial Intelligence

Timur Madzhidov

CC2AI: Computational Chemistry meets Artificial Intelligence

Конференция "Вычислительная химия встречает искуственный интеллект" в Лозанне, Швейцария. Осталось совсем немного времени на подачу тезисов.

The Computational Chemistry meets Artificial Intelligence (CC2AI) conference will be held at EPFL, Lausanne - Switzerland from June 13 to June 15, 2018.

The main goal of this conference is to bring together research groups from biomolecular simulations and ab-initio computations with thos...

Read More