Chemoinformatics News

Ультрамасштабный докинг позволил найти новые типы высокоактивных лекарств

#хемоинформатика #дизайнлекарств #докинг #медхимия

Шикарное исследование, показывающее мощь современных вычислительных инструментов для разработки лекарств. И пример как количество рано или поздно переходит в качество.

В группе Б. Шойше провели докинг более 170 млн виртуальных соединений (!!!) в AmpC β-лактамазу (AmpC) и D4 дофаминовый рецептор. Эти соединения были виртуальными, то есть, в основном, неизвестными, но их потенциально можно было синтезировать с помощью 140 реакций. Библиотека была крайне разнообразной - в ней было более 10 млн новых скаффолдов. Из наиболее высоко ранжированных докингом структур, почти 600 соединений синтезировали и нашли совершенно новые типы лекарств, в том числе с субмикромолярной активностью. Так, нашли принципиально новый фенолатный ингибитор бета-лактамазы, который после оптимизации показал активность при 77 нМ концентрации и стал самым активным их известных соединений против данного белка. Кристаллическая структура полностью подтвердила предсказания докинга. Кроме того, нашли новые типы агонистов дофаминовых рецепторов, в том числе с субнаномолярной активностью, включая 180 пкМ подтип-селективное соединение (!).

Так что докайте на здоровье! 😀

https://www.nature.com/articles/s41586-019-0917-9

Links: