ИСКУСТВЕННЫЙ ИНТЕЛЛЕКТ И ФОЛДИНГ БЕЛКА


ИСКУСТВЕННЫЙ ИНТЕЛЛЕКТ И ФОЛДИНГ БЕЛКА

Новая победа искусственного интеллекта в структурной биологии и химии! Компания DeepMind (подразделение Google) создала систему, основанную на применении искусственного интеллекта для предсказания фолдинга белка (то есть трехмерной структуры на основе аминокислотной последовательности). Метод основан на применении глубоких нейронных сетей особой архитектуры для предсказания углов и расстояний между аминокислотными последовательностями:

"Both of these methods relied on deep neural networks that are trained to predict properties of the protein from its genetic sequence. The properties our networks predict are: (a) the distances between pairs of amino acids and (b) the angles between chemical bonds that connect those amino acids. The first development is an advance on commonly used techniques that estimate whether pairs of amino acids are near each other.

We trained a neural network to predict a separate distribution of distances between every pair of residues in a protein. These probabilities were then combined into a score that estimates how accurate a proposed protein structure is. We also trained a separate neural network that uses all distances in aggregate to estimate how close the proposed structure is to the right answer."

https://deepmind.com/blog/alphafold/

Links:


December 04, 2018 at 07:19. Timur Madzhidov