Проект "Повышение эффективности первичного скрининга биологически активных соединений с использованием вычислительных моделей"


Последняя версия модуля GTM subset selection (Python) доступна для скачивания по ссылке: download

GTM subset selection - это модуль, написанный на языке программирования Python, для выборки минимального набора данных с развномерным покрытие карты GTM. Данный подход позволяет отобрать наиболее разнообразные молекулы в выборку. Для работы алгоритма нужны проекции молекул на карту GTM (file.svm or file.rsvm) и специально форматированный файл с биологическими активностями(y.txt).

Зависимости

CIMtools >= 3.0

CGRtools >=3.0

jupyter last version

python 3.7


January 14, 2019 at 09:57. Valentina Afonina